Suzume es una adolescente normal que vive junto a su tía en un pueblo tranquilo en la región suroeste de Japón. Cierto día, mientras iba de camino al colegio, la joven se cruza con un misterioso hombre que llegó al lugar en busca de cierta puerta y ella le da indicaciones para que pueda llegar a unas ruinas en medio de la montaña. Sintiéndose atraída por el desconocido, Suzume va detrás de él y termina encontrando en medio de las ruinas una misteriosa puerta blanca. Dejándose llevar por su curiosidad, ella abre la puerta liberando, sin saberlo, una misteriosa energía que desencadenará una serie acontecimientos que pondrán en peligro tanto a la ciudad como a todo Japón.